Первоначально являлся приложением к газете «Известия Томского городского общественного управления». В 1906 году журнал выходил ежемесячно под названием «Сведения по медико-лечебной, санитарной и ветеринарной организации Томского городского управления». В 1907 году «Хроника» стала выходить как отдельное издание. В роли издателя выступало санитарное бюро Томской городской управы. Журнал выходил вплоть до 1917 года.

Составление первых номеров осуществлял заведующий санитарным бюро, санитарный врач К. М. Гречищев. С 1908 года редактором стал врач А. Н. Боголюбов. В журнале публиковались постановления Томской городской думы по врачебно-санитарной части, протоколы заседаний, отчеты, статьи о состоянии санитарии и здравоохранения, текущая хроника. «Врачебно-санитарная хроника» выходила тиражом 200 экземпляров.