Преображенская церковь, каменная, одноэтажная, трехпрестольная, была заложена в 1848 году и строилась до купола на средства купца С. В. Ерлыкова, поэтому была известна среди местных жителей под названием Ерлыковской. Строительство было закончено в 1868 году на средства купца Е. И. Королева.
В 1892 году при храме было открыто церковно-приходское попечительство. В церковной библиотеке насчитывалось до 80 томов книг.
В 1920 году храм был национализирован. В сентябре 1933 года здание церкви было признано аварийным, а в 1935 году постановлением Западно-Сибирского крайисполкома Преображенская церковь была закрыта. В 1936 году здание было снесено.
Преображенская церковь (Ерлыковская) на Верхней Елани 1868 // Православные храмы Томска: альбом. – Томск, 2005. – С. 24.