Первая в Томске синагога открылась в 1850 г. в 1-этажном каменном здании в районе Песков; в 1902 г. на этом месте было построено новое каменное здание Хоральной синагоги.
В 1920-40 гг. все томские синагоги были закрыты. В 1999 г. здание Хоральной синагоги было возвращено еврейской религиозной общине, зарегистрированной в марте 1992 г. и вошедшей в состав созданного в 1993 г. Конгресса еврейских религиозных организаций России.
Кижнер, Д. М. Синагога // Энциклопедия Томской области. Т. 2. – Томск, 2009. – С. 717.